双击Install AT91-ISP v1.13.exe运行，选择默认设置，安装好以后，桌面上生成如下两个图标。SAM-BA编程工具下载断开图中B处的短接。在所需软件准备就绪之后，下面需要做就是本篇的重点了——擦除AT91SAM7S64 Flash（因为内部固件已经损坏，所以这步是必须的）然后进入编程模式，具体操作流程如下：（7）点击Write Flash 按钮，烧录固件，待烧录完成后，Active Connection：将变为1，然后拔掉USB数据线即可。短接图中A的两个过孔约5秒。
点击Write Flash 按钮，烧录固件，待烧录完成后，Active Connection：将变为1。（4）短接TST区的两个过孔（即TST与VDD3.3v），然后再连接USB数据线给J-Link供电（注意顺序），约10s以后，拔掉USB电源，再断开TST区的连接，这时进入编程模式；最新版本的sam-ba_2.15单片机编程工具，能够利用DEBUG串口和USB接
